Antibiyotiğe bağlı ishal genelde kısa sürelidir ve ilaç kullanımı kesildikten sonra geçer. Ancak antibiyotik sebepli olan ishalin mikrobiyota üzerindeki etkileri uzun süre görülmeye devam eder (uzamış disbiyozis). Ama bazı durumlarda ülseratif kolit ya da pseudomembran (yalancı membran) kolite de neden olabilir. İkisi de karında şiddetli ağrıya, ateşe ve kanlı ishale sebebiyet verir.

Antibiyotiğe bağlı ishal, geniş spektrumlu antibiyotik kullanan çocukların yaklaşık %35’inde görülen bir yan etkidir. Tedavi süresini uzatmakta ve tedavi masraflarını önemli ölçüde artırmaktadır. Ek olarak başka enfeksiyonlara da yatkınlığı artırmaktadır. Her yıl çok sayıda çocukta antibiyotik kullanıldığı göz önüne alındığında konunun önemi anlaşılır. Probiyotik mikroorganizmalar verilerek bağırsaklardaki mikrobiyal aktivite normale döndürülmeye çalışılmalıdır.